Le logiciel laisse une grande autonomie aux élèves. Il n’y a pas de contrôle pas à pas de l’application. Il faut donc habituer les élèves à réfléchir à ce qu’ils veulent démontrer. La première fois, les élèves sont le plus souvent perdus et ne savent pas quoi faire. Ils cliquent sur certains boutons au hasard ou s’amuse à injecter des produits dans la souris alors que l’on étudie la croissance de la moutarde… Les élèves devront comprendre qu’il faut élaborer une stratégie de résolution avant de manipuler le logiciel.